В рамках договоров о творческом сотрудничестве институт работает с Институтом ветеринарной медицины Монголии и Ветеринарным институтом Таджикской академии сельскохозяйственных наук.

Сотрудники института проводят исследования по адаптации методов оценки качества мёда в соответствии с требованиями ЕЭС и ВТО.

Испытательная лаборатория, аккредитованная Госстандартом РФ, проводит контроль качества ветпрепаратов, кормов, кормовых добавок и сырья животного происхождения, ввозимых в Россию из разных стран (США, Германия, Голландия, Испания и др.).

В 2013 году во ВНИИВСГЭ была организована и проведена международная конференция «обеспечение качества и безопасности продуктов животного происхождения», в которой приняли участие 117 специалистов. Совместно с другими НИИ организован и проведен 4 съезд ветеринарных фармакологов и токсикологов России «Актуальные вопросы ветеринарной фармакологии, токсикологии и фармации».

Учёные института участвовали в работе международного ветеринарного конгресса (организован Российской ветеринарной ассоциацией и национальным союзом свиноводов, г.Москва), международного конгресса Апимондии (Киев), Евразийской конференции по пест-менеджменту «Управление численностью проблемных биологических видов» (Институт проблем экологии и эволюции им.А.Н.Севрецова РАН г.Москва), международных научно-практических конференций: «Безопасность пищевых продуктов» (Москва), «Человек, пчела и будущее» (Украина), «П.И.Прокопович в мировом пчеловодстве» (Украина), «Интермёд-2013» (Москва), «Актуальные вопросы товароведения и безопасности товаров» (г.Коломна), «Научное обеспечение инновационного развития животноводства» (Беларусь), «Молодые ученые в решении актуальных проблем науки» (РСО-Алания), семинаре «Пищевая безопасность в индустрии питания.ЗМТМ. Система молекулярного анализа патогенных микроорганизмов» (Москва).